■巡視船
PLH	ヘリコプター搭載大型巡視船です。遠海での領海警備や遭難者の輸送に威力を発揮します。また近年は海賊対策等で、海外に派遣される機会も増えています。世界最大の巡視船「しきしま」（２機搭載型）や「みずほ」（２機搭載型）、砕氷巡視船「そうや」（１機搭載型）、「ざおう」（１機搭載型）などです。瀬戸内海を担当とする第六管区を除く全ての管区に配備されています。
PL	大型巡視船です。遠海での警備・救難に威力を発揮します。３０００トン型、１０００トン型、３５００トン災害対応型「いず」などです。近年の新造船は、不審船対策などで、高速化が図られ、射撃統制装置付の高性能機関砲が搭載されています。また防御面も強化されています。 練習船「こじま」（海上保安大学校）・「みうら」（海上保安学校）は３０００トン型巡視船です。
PM	中型巡視船です。大型巡視船の補完的な役割を果たすタイプのほか、事故対応能力強化したタイプなどがあります。５００トン型、３５０トン型などです。近年は高速・高性能機関銃搭載タイプが量産されています。
PS	小型巡視船です。現在は不審船事件を受けて時速３０ノット〜５０ノット以上出せる高速タイプが主流です。大半が防弾板を追加し、高性能機関銃を搭載しています。１８０トン型、特１３０トン型、１８０トン捕捉機能強化型、２２０トン型高速特殊警備船などです。

■消防船
FL	その名の通り、大型タンカーなどの火災に対応します。伸縮式の放水銃を持ち、重心が高くなるので安定性確保のため双胴船形となっています。船内は与圧され、排気は冷却されて排出されます。巡視船艇の任務の多様化の中、今後も専用船が建造されるか注目されています。
■巡視艇
PC	大型巡視艇です。３５メートル災害対応型・消防機能強化型、領海警備が主任務の３０メートル型、航路哨戒が主任務の２３メートル型など様々なタイプがあります。「まつなみ」は迎賓艇を兼ねています。
CL	中・小型巡視艇です。保有船艇中、最多を誇ります。主に沿海の警備救難業務を担当します。２０メートル型、１５（１８）メートル型などです。２０メートル型は１００隻以上建造されています。
■消防艇
FM	大型タンカーなどの火災に対応します。現存船は老朽化しつつあり、新型の消防機能強化型巡視艇（現消防艇より放水量増）が代替船として建造されていく予定です。
■以下は特殊警備救難艇です。
■警備艇
GS	関西国際空港の建設現場の警備用に建造された警備専用艇です。高速力と高機動性を誇ります。現在は関西国際空港周辺海域の警備に就いています。
■放射能調査艇
MS	原子力船が入港した際、放射能を測定する調査艇です。専用艇の「きぬがさ」以外は警備救難業務もこなします。科学技術庁（現文部科学省）の予算で整備されています。
■監視取締艇
SS	プレジャーボートの指導取締り、密漁船の取締りなどを行います。見た目は普通のプレジャーボートで、覆面パトカーに近い存在です。韓国の高速密漁船対策で時速５０ノットを出せるタイプ、隠密任務のため、船影の公開されていないタイプなどがあります。
■油防除艇
OR	石油流出事故などの際、オイルフェンスを展開し、油を回収します。油回収装置と５００メートルのオイルフェンスを搭載しています。
■油回収艇
OS	石油流出事故などの際、油を回収します。油回収装置を搭載しています。小型のため、分割してトレーラーで陸送する事もできます。
■オイルフェンス展張艇
OX	石油流出事故などの際、搭載しているオイルフェンスを展開します。走行用の機関が付いていないので、現場海域まで巡視船艇で曳航されて行きます。

■測量船
HL	大・中型測量船です。沿岸・海底地形の測量、海流情報などの収集、火山噴火予知調査などを行います。長期間（約３ヶ月間）の調査も行います。
HS	小型測量船です。離島や小港湾の測量、沿岸防災情報図用の調査などを行います。

■航路標識測定船
LL	電波標識の有効範囲や精度、光波標識の視認状況などを確認する世界で唯一の専用船です。補修や新設計画のデータ収集も行います。航路標識測定船「つしま」
■設標船
LL	浮標の設置・回収を行う大型設標船です。
LM	港湾周辺などの浅い海域の浮標の設置・回収を行う中小型設標船です。
■灯台見回り船
LM	中・小型の灯台見回り船です。灯台だけでなく、各種航路標識の保守点検を行います。
LS	小型の灯台見回り船です。近年は専用艇だけでなく、警備救難業務に対応できるようにしたものもあります。

■実習艇
あおば	一級小型船舶操縦士資格の実技訓練に使用されています。海上保安学校に配属されています。海上保安大学校の学生も海上保安学校で実技訓練を受けます。
C�T	四級小型船舶操縦士資格の実技訓練に使用されていました。

基本的には以下の命名基準に基づき、配属地域を考慮してを命名されます。そのためほとんどの場合、配属先が大きく変わるとそのたびに船名が変わります。さらに最近は、地元住民しかわからないような名前も増えています。